В каких странах самые опасные штаммы коронавируса

Смертоносная эволюция: откуда берутся новые варианты COVID-19 и какие из них самые опасные

Ученые отслеживают мутации коронавируса, чтобы исследовать их и определить потенциальный вред, которые они могут нанести. Варианты коронавируса заносят в списки и точечно тестируют каждый. Рассказываем, какие из уже изученных штаммов потенциально более опасны и почему.

Читайте «Хайтек» в

Как появляются штаммы

Вирусы размножаются только внутри живой клетки, используя ее ресурсы. Для этого им нужно удвоить РНК. Это сложный многоступенчатый процесс, в котором возникают ошибки. Самые типичные — перестановка нуклеотидов, замена одного на другой. Это называют точечной мутацией. При удвоении РНК возможны потери небольших последовательностей или, наоборот, вставка.

В мире не существует общепризнанной номенклатуры названия штаммов, и используемые названия достаточно произвольны. Как правило, они состоят из отдельных букв и цифр, которые записываются после видового названия. Например, один из самых известных штаммов кишечной палочки — E. coli K−12.

Вирус старается исправить сбои репликации, но не всегда удачно. Если мутация дает патогену какое-то жизненное преимущество, она может закрепиться.

На данный момент известно, что SARS-CoV-2 накапливает мутации примерно с той же скоростью, что и возбудитель гриппа. Мутации в геноме коронавируса нового типа почти всегда возникают не из-за случайных ошибок во время его копирования, как у многих других вирусов, а в результате повреждения или неправильного редактирования уже готовой копии РНК вируса.

Как находят новые штаммы COVID-19

У больных берут образцы слизистой и расшифровывают геном возбудителя. Эту информацию загружают в общие базы данных и сравнивают. Например, в базе GISAID больше 2 млн геномов коронавируса со всего мира. Там есть трекер, визуализирующий, какой вариант в какой стране выявили.

К 16 января Роспотребнадзор сообщил, что придумал специальный тест, который будет определять британский штамм. Результат он покажет через 1,5 часа после того, как у человека взяли мазок.

Нужны более углубленные и сложные тесты, чтобы сказать, какой штамм у больного. Сейчас [с помощью ПЦР-тестов] можно выяснить, есть ли в человеке активный вирус — есть некий вариант COVID-19 или нет. Но это не значит, что вообще нельзя определить конкретный штамм, просто на это нужно больше времени и денег.

Алексей Аграновский, профессор МГУ и доктор биологических наук

Поэтому в России узнать, как много человек заразились коронавирусом с определенной мутацией, пока невозможно, но можно делать выборочные тесты, чтобы понять, насколько широко некий штамм X распространен.

На сайте CoVariants, использующем данные GISAID, можно увидеть, какие мутации отличают геном того или иного варианта. Так, у дельта-варианта четыре значимые мутации в белке-шипе и две делеции.

Самые опасные варианты COVID-19

ВОЗ причислила к опасным четыре варианта: альфа, бета, гамма и дельта.

  • Альфа

Штамм был впервые обнаружен в октябре 2020 года во время пандемии COVID-19 в Великобритании из образца, взятого в предыдущем месяце.

С тех пор его шансы на преобладание удваивались каждые 6,5 дней (предполагаемый интервал между поколениями). Это коррелирует со значительным увеличением частоты инфицирования COVID-19 в Великобритании.

Есть некоторые свидетельства того, что этот вариант имеет на 30–70% повышенную трансмиссивность, кроме того, предварительные исследования предполагают повышение летальности.

Однако по мере того, как происходит больше мутаций, может потребоваться изменение вакцины. SARS-CoV-2 не мутирует так быстро, как, например, вирусы гриппа, и новые вакцины, которые доказали свою эффективность к концу 2020 года, представляют собой типы, которые при необходимости можно изменить.

По состоянию на конец 2020 года органы здравоохранения и эксперты Германии, Великобритании и Америки считают, что существующие вакцины будут столь же эффективны против штамма VOC-202012/01, как и против предыдущих штаммов.

  • Бета

Штамм был впервые обнаружен в Южной Африке, о чем было сообщено министерством здравоохранения ЮАР 18 декабря 2020 года. Исследователи и официальные лица сообщили, что распространенность этого штамма была выше среди молодых людей без каких-либо основных заболеваний, и по сравнению с другими штаммами он чаще приводит к серьезным заболеваниям в этих случаях.

Ученые отметили, что этот штамм содержит несколько мутаций, которые позволяют ему легче прикрепляться к клеткам человека.

8 января 2021 года Guardian сообщила, что вакцина Pfizer и BioNTech от COVID-19 показала в тестах, включающих 20 анализов крови, что она способна обеспечивать защиту от штамма 501.V2. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы установить точную степень защиты.

24 февраля 2021 года компания «Модерна» объявила о начале клинических исследований новой версии своей вакцины. Новая версия разработана специально для борьбы с 501.V2.

  • Гамма

Штамм был впервые обнаружен в Токио 6 января 2021 года Национальным институтом инфекционных заболеваний (NIID). Новый штамм был обнаружен у четырех человек, прибывших в Токио из штата Амазонас 2 января 2021 года.

Новый штамм впервые появился в июле и впервые был обнаружен в октябре, но на момент публикации (декабрь 2020 года), хотя частота его значительно увеличилась, его распространение все еще в основном ограничивалось столицей штата Рио-де-Жанейро.

Новой была мутация белка-шипа K417T, позволяющая вирусу более прочно связываться с клетками человека, а в некоторых случаях даже избегать антител. К тому же вирус сильнее поражает молодых людей и беременных женщин, чем оригинальный.

11 февраля 2021 глава минздрава Бразилии Эдуардо Пазуелло сообщил о том, что данный штамм в три раза заразнее «оригинального» SARS-CoV-2.

  • Дельта

В октябре 2020 года линия B.1.617.2 впервые была обнаружена в Индии. Во второй половине апреля 2021 года индийский штамм дельта попал в Россию.

14 июня 2021 года в Индии был обнаружен мутировавший вариант B.1.617.2, который известен как вариант AY.1, или дельта плюс. Дельта плюс отличается наличием в спайковом белке мутации K417N, которая способна снижать активность антител у переболевших и вакцинированных людей.

Минздрав Индии назвал три отличительных признака дельты плюс: повышенная контагиозность, усиленная способность связываться с рецепторами клеток легких и потенциальная устойчивость к терапии моноклональными антителами.

К началу июля 2021 года Всемирная организация здравоохранения зафиксировала дельта-штамм в 98 странах как с высоким, так и с низким уровнем вакцинации населения, во многих странах он становится доминантным.

По данным Российского консорциума по секвенированию геномов SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), дельта-штамм занимал чуть больше половины (52%) в образцах, полученных в Санкт-Петербурге в мае 2021 года, а в июне 2021 года — более 90%.

Также к категории угрожающих относится и дельта плюс, выявленный в июне прошлого года в Непале. У него пять мутаций в белке-шипе, которые делают вирус очень опасным.

За какими вариантами COVID-19 следят ученые

В списке ВОЗ еще четыре варианта SARS-CoV-2, которые представляют интерес, но пока нет оснований считать их более опасными: эта, йота, каппа, лямбда.

  • Лямбда

Так называемый лямбда-штамм SARS-CoV-2 впервые выделили в Перу в конце лета прошлого года. Заражения новым штаммом также зафиксировали в Аргентине и Чили. Впоследствии он распространился в Германии, Испании, США, Великобритании и ряде других стран.

В геноме лямбда-штамма есть набор из восьми ключевых мутаций, которые, предположительно, повышают заразность вируса. Бразильские ученые под руководством Присцилы Уинк из Федерального университета Рио-Гранде-ду-Сул впервые зафиксировали следы лямбда-варианта SARS-CoV-2 на территории Бразилии и обнаружили новую разновидность этой версии вируса. Штамм лямбда обнаружен по данным на 19 июля в 29 странах

  • Йота

Штамм выявили в марте прошлого года в Нью-Йорке, он распространялся на 35% быстрее. Какое-то время успешно конкурировал с альфой, ученые предполагали, что в сочетании с мутацией E484K в белке-шипе, помогающей ускользать от антител, этот вариант будет опасен. ВОЗ присвоила ему статус угрожающего. Но эти прогнозы не оправдались, и теперь за ним просто наблюдают.

В России — 139 штаммов коронавируса. Какие из них самые опасные?

Заведующий лабораторией молекулярной вирусологии НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева Андрей Комиссаров о вариантах коронавируса, циркулирующих в России и мире.

Основные штаммы, которые вызывают обеспокоенность в настоящее время:

— Alfa, британский штамм — B.1.1.7;

— Beta, южноафриканский штамм — B.1.351;

— Gamma, бразильский штамм — P1;

— Delta, индийский штамм — B.1.617.2.

Штаммы COVID-19 в России

В России циркулируют вирусы SARS-CoV-2, принадлежащие к различным генетическим линиям. Всего выявлены представители 139 из 1296 линий (штаммов) по классификации PANGO — самой дробной из известных систематизаций штаммов.

Не для всех регионов есть достаточные объемы данных. По ряду регионов есть большой объем данных, но для большего числа регионов данные фрагментарные. Наиболее охвачены генетическими исследованиями Санкт-Петербург, Москва, Екатеринбург, Свердловская область (в 2020 году также Омская область).

Британский штамм B.1.1.7 циркулирует в России с начала 2021 года. Его доля росла, однако с появлением индийского штамма, рост как минимум прекратился, и можно предположить, что доля этого штамма будет снижаться. И то, что мы видим по данным Великобритании, показывает, что конкурентную борьбу с индийском штаммом британский проигрывает.

Линия АТ.1 (B.1.1.370.1) — северо-западный вариант коронавируса. Это линия, эндемичная для России. Возникла на северо-западе страны, первые образцы выявили в январе-феврале 2021 года в Псковской области и Санкт-Петербурге.

Интересная своеобразным, нетипичным, уникальным набором замен. Особый интерес представляют замены в спайк-белке. Такого не встречается ни в каких других коронавирусах.

Читайте также  Когда нужно копать морковь и почему важно не ошибиться со сроками

Он распространен на данный момент в Санкт-Петербурге, Ленинградской, Псковской, Новгородской областях, Москве и Белгородской области.

Случаи заражения этим штаммом зарегистрированы также в Финляндии, Германии, Великобритании, США и Израиле.

По данным ПЦР-скрининга, около 16% госпитализированных пациентов в КИБ им.Боткина в мае этого года были заражены именно этим штаммом.

С появлением индийского штамма доля AT.1 начала снижаться, но пока не упала до нуля.

Линия B.1.1.523. Количество штаммов этой линии медленно, но нарастает. В основном он распространен в Москве, Центральном Федеральном округе, также отдельные образцы выявили в Санкт-Петербурге, Свердловской области и Ставропольском крае.

Частота южноафриканского штамма B.1.351 в России очень низкая.

Как меняется ситуация в 2021 году

В начале 2021 года основными в России были родительская линия B.1.1 и дочерние, эндемичные для России, B1.1.317, B.1.1.397, и в очень небольших количествах наблюдался британский штамм B.1.1.7.

Дальше ситуация менялась. Эндемичные российские линии сходили на нет, количество британского штамма постепенно увеличивалось.

Возникла новая российская эндемичная линия AT.1 (северо-западный штамм), получившая также распространение и в других странах.

Начиная со второй половины апреля, после первых случаев завоза индийского штамма B.1.617.2 в Россию, начало увеличиваться число выявляемых случаев заражения именно этим штаммом.

Индийский штамм в России

Индийский штамм зарегистрирован в 63 странах. Он характеризуется важными заменами в спайк-белке.

Сейчас происходит очень быстрое увеличение доли этого вируса, и эта ситуация характерна не только для отдельных регионов нашей страны, но также и для Великобритании, например, где этот штамм очень активно вытесняет британский штамм.

Это штамм, вызывающий наибольшую обеспокоенность как глобально, так и в частности, в масштабах России, где в ряде регионов он очень быстро вытесняет другие.

Эффективность «Спутник V» против новых штаммов

Вакцина «Спутник V» эффективна против всех основных вариантов, вызывающих опасение: британского, южноафриканского, бразильского, индийского штамма и доминирующих локальных линий, заявил во время семинара руководитель лаборатории механизмов популяционной изменчивости патогенных микроорганизмов ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России Владимир Гущин .

Вируснейтрализующее свойство может снижаться для различных штаммов, что может приводить к небольшому повышению заражений с легким течением болезни, но при этом нельзя говорить о серьезном снижении или полном отсутствии эффективности вакцины.

Риск перенести заболевание в среднетяжелой и тяжелой форме у получивших две дозы вакцины «Спутник V» в случае заболевания в 14 раз ниже, чем у невакцинированных.

Эксперты оценили опасность выявленной в Москве мутации коронавируса

Фото: Hendrik Schmidt / dpa / Global Look Press

Новая мутация коронавируса АY.4.2 является более заразной версией дельта-штамма и вскоре этот вариант вытеснит привычную дельту, рассказал РБК директор Центра глобальной вирусологической сети, советник ВОЗ, профессор Университета Джорджа Вашингтона Константин Чумаков.

Ранее глава Роспотребнадзора Анна Попова заявила, что в Москве и Подмосковье обнаружена новая мутация коронавируса АY.4.2, которую ранее выявили в Великобритании.

«Это и есть дельта-штамм, только некоторые его называют дельта плюс. В штамме дельта появилась еще одна мутация, и, судя по всему, она делает вирус более заразным. <. > АY.4.2 постепенно увеличивается среди других штаммов, которые просто дельта, то есть постепенно этот вариант вытесняет стандартную дельту», — объяснил Чумаков.

Он отметил, что в Англии отслеживают, какие штаммы сейчас циркулируют, и доля штамма с мутацией АY.4.2 постепенно увеличивается среди других вариантов. «Он более заразный. Что касается тяжести болезни, то трудно сказать, потому что пока таких данных прямых нет, потенциально это может быть, но необязательно. Не думаю, что это чрезвычайная ситуация и принципиально новый штамм», — заключил эксперт.

Как заявил РБК научный руководитель ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И. И. Мечникова» Виталий Зверев, пока не доказано, что штамм АY.4.2 распространяется быстрее. «Говорили о том, что он быстрее распространяется, чем предыдущий вариант, но дело в том, что это не доказано. Никто не скажет, насколько быстрее он будет распространяться», — сказал он.

По его словам, это не тот вариант мутации, которого следует бояться и говорить, что люди, которые «переболели предыдущим, будут болеть новым или что не будут работать вакцины». «А то, что он стал быстрее распространяться, это, скорее всего, поведенческие реакции, связанные с погодными условиями, снятиями каких-то ограничений. То, что он заменит какие-то варианты, которые циркулируют сейчас, — это далеко не факт, об этом можно будет сказать только через какое-то время», — подчеркнул эксперт.

Кроме этого, Зверев привел в пример английский вариант коронавируса, про который также говорили, что он быстрее распространяется. «Самое главное, что это не новый штамм, не тот, который как-то повлияет на коллективный иммунитет, что вырабатывается в обществе», — добавил он.

Фото:Андрей Любимов / РБК

19 октября о распространении штамма AY.4.2, который является вариацией дельта-штамма, предупреждали ученые из Института Сенгера в Кембридже и Института генетики в Университетском колледже Лондона. По их словам, эта мутация может быть на 10–15% более заразной, чем индийский штамм. Они также предположили, что новый вариант приходится почти на 10% всех случаев заражения в Британии и он активно распространяется.

Министр здравоохранения Великобритании Саджид Джавид тогда заявил, что нет оснований считать, что AY.4.2 представляет повышенную угрозу. «И хотя пока нет каких-либо оснований считать, что AY.4.2 представляет повышенную угрозу, следующий штамм или штамм, который появится после него, может оказаться более опасным», — сказал он.

21 октября об обнаружении в России единичных случаев коронавирусной инфекции AY.4.2 также сообщал руководитель научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов. По его словам, вариант AY.4.2 — одно из множества ответвлений дельта-штамма, которое, вероятно, «имеет ряд преимуществ перед исходной и остальными версиями вируса». При этом специалист отметил, что о большей заразности мутации говорить пока рано.

За последние сутки в России коронавирусом заболели 37 930 человек, всего им заразились 8,3 млн россиян, из них 231,7 тыс. умерли. При этом за день от инфекции скончались 1069 заболевших.

Пять новых штаммов коронавируса: чем опасны и чего от них ждать?

Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.

Но ученые были правы лишь наполовину. Вирус и правда не принес ничего хорошего — но оказалось, что и стабильностью он не отличается. С тех пор, как SARS-CoV-2 «перепрыгнул» с животных на людей, он накапливал незначительные случайные мутации: как однобуквенные «опечатки» в генетической последовательности вируса, так и вставки или выпадение более длинных фрагментов вирусной РНК. Большинство мутаций либо убивают вирус, либо никак не меняют его строение и поведение.

Но недавно было обнаружено несколько новых штаммов оригинального вируса (его также называют «вирусом дикого типа»), мутации которых, похоже, сильно влияют на его свойства, в том числе на контагиозность. Эти штаммы были обнаружены один за другим в разных географических регионах (Великобритания, ЮАР, Бразилия) и в некоторых случаях стали доминировать над штаммами, распространенными в этих регионах ранее. Одновременное появление сразу нескольких штаммов в поле зрения ученых частично объясняется улучшением технологий мониторинга случаев заражения и увеличением объемов секвенирования вирусов. Однако схожесть паттернов мутаций в новых штаммах может указывать на то, что эти изменения не случайны.

«Мы видим, как похожие мутации появляются в разных местах, — говорит Адам Лоринг, вирусолог из Мичиганского университета. — Это наводит на размышления о том, что они для чего-то нужны».

Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.

По последним данным, вакцины, производимые компаниями Moderna и Pfizer, скорее всего, защищают и от новых штаммов коронавируса. Разработчики «Спутника V» также заявили о его эффективности против мутировавшего вируса. Эффективность вакцин этих производителей превышает 90 %, поэтому, по мнению экспертов, даже при небольшом снижении этой цифры их все равно стоит использовать.

«Я рад, что это не лишает смысла [использование вакцин от COVID-19], но, очевидно, требует пристального внимания», — говорит Лоринг. Он добавляет, что на протяжении следующих лет компаниям, возможно, придется изменить эти вакцины и начать вводить пациентам новые их версии — подобно тому, как каждый год меняют вакцины от гриппа. Большинство вакцин вызывают намного более сильный иммунный ответ, чем естественное заражение вирусом. Во время клинических испытаний своей вакцины компания Moderna показала, что антитела, вырабатываемые после вакцинации, остаются в организме дольше, чем антитела, вырабатываемые при естественном заражении SARS-CoV-2.

по теме

Эпидемия

Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников

Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.

Читайте также  10 удивительных преимуществ шампуня с маслом Ним

Испания

Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.

Великобритания

Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.

Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.

Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.

Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.

ЮАР

Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.

Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.

В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.

Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.

Бразилия

В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.

Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.

Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.

Распространение и изменение вирусов

Хотя кажущееся внезапным появление нескольких вариантов белка шипа является причиной для беспокойства, по словам исследователей, пока нет доказательств, что коронавирус претерпел какие-либо принципиальные изменения, позволяющие ему мутировать быстрее. По мнению Лоринга, более вероятно, что большое число заражений COVID-19 по всему миру предоставляет вирусу множество возможностей для постепенных небольших изменений. Каждый зараженный человек — это, по сути, дополнительный шанс для возникновения нового штамма SARS-CoV-2. «Это имеет отношение к эволюции, но в первую очередь — это вопрос эпидемиологии», — говорит Лоринг. В целом «вирус совершенствуется в своей роли».

Так ли страшны новые штаммы? Ответы на самые важные вопросы о мутациях коронавируса

Появление новых штаммов коронавируса, имеющих необычные свойства, вызывают тревогу людей во всем мире. Руководитель научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов рассказал о том, что сейчас известно о мутациях COVID-19 и нужно ли будет ежегодно от него прививаться, как мы это делаем в случае с гриппом.

— Сколько всего штаммов коронавируса выявлено на сегодняшний день в мире?

— В первую очередь стоит обратиться к определению штамма вируса как некоторого варианта патогена, который обладает уникальными и стабильными фенотипическими характеристиками. При этом стоит отметить, что вирусы, особенно РНК-содержащие, постоянно мутируют, перебирая разные варианты изменений в геноме, и даже внутри одного человека может содержаться множество версий одного вируса, отличающихся отдельными изменениями в геноме, которые далеко не всегда приводят к образованию нового штамма.

Варианты SARS-CoV-2 циркулируют во всем мире, и после появления некоторые варианты довольно быстро исчезают, другие, наоборот, закрепляются в популяции, процесс динамический. Сколько всего штаммов нового коронавируса существует в природе на данный момент, неизвестно, в том числе из-за размытости самого понятия и факта того, что свойства многих геновариантов вируса пока не изучены.

Так, популярный ресурс PANGO lineages выделяет значительное число отдельных линий патогена, и различные организации во всем мире изучают варианты вируса, чтобы понять, являются ли они более контагиозными, изменяющими тяжесть течения заболевания, детектируемыми доступными диагностическими тестами, отвечающими на терапию, изменяющими эффективность вакцин против COVID-19 и т.п. Потому куда чаще термин «штамм» используется для каких-то особо интересных вариантов патогена, как, например, британского или южноафриканского, которые характеризуются ключевыми изменениями в геноме и имеют важные (часто выгодные патогену) свойства. Так, было введено понятие VoC (от англ. Variants of Concern. — Прим. ред.) — «варианты, вызывающие беспокойство», к которым сейчас причисляют несколько штаммов, включая вышеперечисленные.

Александр Плонский/ТАСС

— Сколько из них есть в России?

— Строгого ответа нет. Какая-то доля всех штаммов коронавируса, которые распространяются на планете, есть уже и в России, какие-то будут завезены в будущем, какие-то появятся у нас в стране независимо. Ученые во многих лабораториях в мире и в нашей стране сейчас проводят активную работу по секвенированию геномов патогена из различных регионов, чтобы как можно быстрее выявлять новые варианты, мониторить скорость их распространения, устанавливать источники заносов из-за рубежа, определять свойства, корректировать тест-системы в случае необходимости. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.

Читайте также  Грибной суп с тмином

— Какие штаммы коронавируса самые опасные и проникают внутрь всего организма, а какие — наоборот?

— Как уже говорил выше, само определение штамма подразумевает новые стойкие свойства патогена. Чаще всего приходится иметь дело либо с повышенной заразностью вируса (как, например, в случае с британским штаммом, который, по различным оценкам, примерно на 50% более заразен, чем другие, «старые» версии), либо же со снижением эффективности связывания с нейтрализующими антителами, возникшими после вакцинации или перенесенного ранее заболевания (так в случае с южноафриканским вариантом).

При этом сразу хотел бы отметить, что уменьшение эффективности вовсе не означает отсутствие защиты, но она может быть несколько снижена. В любом случае всячески выступаю за вакцинацию, которая если и не защитит на 100% от заболевания, то может кардинально снизить тяжесть его протекания.

— Какие штаммы наиболее всего распространены в Москве, какими больше всего болеют в России?

— За последнее время мы видим несколько сотен завозов британского штамма как по России, так и в Москве, что вполне ожидаемо ввиду его свойств. Появляются и некоторые локальные российские версии вируса, у которых встречаются мутации в геноме, характерные для британского и южноафриканского вариантов, но пока преждевременно говорить о том, что они действительно обладают какими-то особыми для людей свойствами. По этой же причине мы не хотели бы сейчас раздавать новые имена таким вариантам, по крайней мере до накопления достаточного объема данных.

Гавриил Григоров/ТАСС

— От всех ли штаммов болезнь длится одинаково или есть разница?

— В какой-то момент появилась информация, что пациенты с британским вариантом инфекции болеют тяжелее, и летальность в таких случаях выше. Это впоследствии было опровергнуто другими исследованиями, и с тех пор я не видел новой информации. Похожая информация появлялась и про калифорнийский вариант.

Нужно отметить, что тяжесть протекания заболевания зависит от множества факторов, и, как известно, многие вообще переносят болезнь бессимптомно, кто-то же крайне тяжело. Такие факторы, как наличие сопутствующих заболеваний, общее состояние организма, возраст, играют существенно большую роль в развитии тяжелой болезни, чем наличие мутаций в геноме патогена, по крайней мере известных на данный момент.

— Может ли бы такое, что к одному штамму коронавируса у человека есть иммунитет, а к другому нет?

— Перенесенная ранее коронавирусная инфекция или вакцинация в норме вызывают иммунный ответ, и в результате в организме появляются нейтрализующие антитела, хотя защита обусловлена не только ими, потому не стоит пугаться, даже если уровень антител невысок или падает. Но да, мы уже знаем, что ряд мутаций в геноме нового коронавируса приводит к изменениям в структуре его белков, придавая патогену новые свойства, иногда удачные для патогена, в том числе с точки зрения снижения связывания нейтрализующими антителами. Потому точно ответить, что к одному штамму у человека есть иммунитет, а к другому нет, нельзя, но эффективность защиты может быть разной, в зависимости от того, с каким новым вариантом вируса вновь встретился пациент.

В связи с этим достаточно вероятна ситуация, что вакцины против нового коронавируса придется периодически обновлять и иммунизироваться ежегодно, как это сейчас происходит с тем же вирусом гриппа. Думаю, к осени мы накопим достаточное количество данных по эффективности существующих вакцин против новых штаммов. Потому еще раз говорю: на данный момент известных причин избегать вакцинации нет, если только нет прямых противопоказаний по состоянию здоровья.

Индийский мутант: Что известно о самом опасном штамме коронавируса — "Дельта"

Как он появился и какие последствия может спровоцировать, учёные пока не знают.

<p>Фото © Satish Bate / Hindustan Times via Getty Images</p>

Фото © Satish Bate / Hindustan Times via Getty Images

Откуда появился новый штамм?

Правительство Индии подтвердило появление индийского штамма в марте 2021 года. По данным ВОЗ, он смог «просочиться» в 50 стран, в том числе в Россию. В Роспотребнадзоре назвали свойственные для индийского штамма CoViD симптомы: частые боли в животе и суставах, тошнота, потеря аппетита и возможная потеря слуха. По словам замдиректора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Натальи Пшеничной, индийские медики и учёные зафиксировали, что у пациентов с этим штаммом чаще встречаются микротромбозы нижних конечностей (закупорка сосудов), из-за которых пальцы на ногах могут даже ампутировать. А вот «традиционные» для коронавируса лихорадка, кашель и потеря обоняния встречаются реже.

Страшнее цитокинового шторма: что такое "мозговой туман" после коронавируса и как его лечить

Директор Федерального исследовательского центра вирусологии и микробиологии Денис Колбасов пояснил, что если штамм вируса называют «индийским», то вряд ли картина будет отличаться от того, что происходило в Индии.

Говорить о том, что в Индии были какие-то глобальные отличия в течении болезни, не стоит. Там ситуация была сложная с точки зрения контроля. Публикаций и сообщений, что штамм вируса в этой стране как-то категорически отличается от всех остальных, я не встречал. Заразность выше или ниже обычных уровней зависит от того, какие меры принимать

Директор Федерального исследовательского центра вирусологии и микробиологии

<p>Говорить о том, что в Индии были какие-то глобальные отличия в течении болезни, не стоит. Там ситуация была сложная с точки зрения контроля. Публикаций и сообщений, что штамм вируса в этой стране как-то категорически отличается от всех остальных, я не встречал. Заразность выше или ниже обычных уровней зависит от того, какие меры принимать</p>

<p>Говорить о том, что в Индии были какие-то глобальные отличия в течении болезни, не стоит. Там ситуация была сложная с точки зрения контроля. Публикаций и сообщений, что штамм вируса в этой стране как-то категорически отличается от всех остальных, я не встречал. Заразность выше или ниже обычных уровней зависит от того, какие меры принимать</p>

По одной из версий, вирус мог мутировать в организмах бездомных — долгое отсутствие лечения и даже плановой (и профилактической) медицинской помощи спровоцировало быстрое распространение болезни и её изменение.

Что с ним не так?

Фото © Arvind Yadav / Hindustan Times via Getty Images

Фото © Arvind Yadav / Hindustan Times via Getty Images

Для тех, кто вакцинировался, есть плохие новости. Замглавы центра им. Гамалеи Денис Логунов сообщил: две мутации индийского штамма существенно снижают активность сывороток у вакцинированных и переболевших. Говоря простым языком — против индийского штамма вакцина работает меньше, и ревакцинацию, возможно, придётся проводить не через год, а через полгода или даже раньше. Министр здравоохранения Михаил Мурашко отметил, что схемы лечения при заражении этим штаммом могут быть скорректированы.

Страшнее ядерной войны. Почему коронавирус считают оружием массового поражения

Российские вирусологи работают над новым штаммом ещё с мая и, скорее всего, антидот для новой мутации придумают. Но именно индийский штамм может спровоцировать третью волну коронавируса по всему миру. Индийский штамм коронавируса уже обнаружили в США, Великобритании и России. Генеральный директор центра «Вектор» Ринат Максютов ещё в мае сообщал, что в Москве, Санкт-Петербурге и Псковской области были выявлены варианты индийского штамма CoViD-19.

Фото © ТАСC / Пётр Ковалёв

Фото © ТАСC / Пётр Ковалёв

Пока учёные заняты разгадкой секрета новой мутации, миллионы людей могут и не подозревать, что заражены. Симптомы у нового штамма больше похожи на ОРВИ: сильный насморк, головная боль. Британские вирусологи и генетики отмечают, что поначалу болезнь развивается как обычный грипп и может «усыплять» бдительность заражённого — не проявлять классических симптомов, например потерю вкуса или обоняния. У молодых и активных людей с хорошим иммунитетом новый штамм CoViD-19 может проявляться как «лёгкое недомогание», которое большинство предпочтёт перенести «на ногах». Британские специалисты отмечают, что основные симптомы могут проявиться гораздо позже или не проявиться вообще — поведение коронавируса до конца не изучено, и сделать однозначный вывод о его активности пока не может никто.

Бесплодие и давление. Как коронавирус меняет здоровье человека

Новый штамм оказался коварнее — в Великобритании он поражает молодых людей в возрасте от 20 до 29 лет. Британская Telegraph отмечает, что против новой мутации частично бессильными оказались зарубежные вакцины — до трети умерших британцев были привиты зарубежными компонентами.

Особо опасный штамм

Фото © ТАСС / EPA / MAXIM SHIPENKOV

Фото © ТАСС / EPA / MAXIM SHIPENKOV

Главврач больницы в Коммунарке Денис Проценко отметил, что за полтора года пандемии болезнь «изменила лицо», а лечить пациентов стало тяжелее. Пациентам с подтверждённой ПЦР коронавирусной инфекцией, по словам главврача, уже не помогают выработанные ранее методы лечения. Преодолеть этот замкнутый круг, по словам Проценко, без вакцинации невозможно.

Первый шаг к лечению болезни — это вакцина «Спутник V». Его уже «натравили» на новый штамм вируса. В РФПИ сообщили, что российская вакцина более эффективна против дельта-варианта коронавируса, впервые обнаруженного в Индии, чем любая другая вакцина в мире.

BREAKING | RDIF: “#SputnikV is more efficient against the Delta variant of coronavirus, first detected in India than any other vaccine that published results on this strain so far — the Gamaleya Center study submitted for publication in an international peer-reviewed journal.” pic.twitter.com/XrwnGNhiNE

— Sputnik V (@sputnikvaccine) June 15, 2021

По словам учёных, появление индийского штамма из-за «симптомов ОРВИ» пропустило большинство стран — вирус не так заметно бьёт по организму, его сложно выявить во время первичных тестов.

Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!: